该报告由中国自然资源部南海生态中心和自然资源部南海发展研究院联合编制。仁爱礁隶属于海南省三沙市，是中国南沙群岛的一部分。中国对南沙群岛及其周边海域拥有无可争辩的主权。1999年，菲律宾一艘军舰在仁爱礁非法“坐滩”，严重侵犯了中国主权。尽管中国政府多次提出严正交涉，要求菲律宾拖走军舰，但至今菲方尚未兑现承诺。

调查结果显示，仁爱礁的造礁石珊瑚覆盖面积显著减少。2024年较2011年，仁爱礁礁盘的造礁石珊瑚覆盖面积总体减少约38.2%，而军舰周边400米范围内的珊瑚覆盖面积减少了约87.3%。此外，仁爱礁向海坡和泻湖坡的珊瑚覆盖面积分别减少了约21.6%和61.2%。

报告指出，非法“坐滩”军舰附近存在大量珊瑚礁碎块和死亡珊瑚，泻湖坡的珊瑚种类和覆盖率明显低于向海坡。礁区的大型底栖无脊椎动物种群结构失衡，军舰周边尤为严重。同时，礁区海水中的重金属、油类和活性磷酸盐含量明显高于历史记录，仁爱礁礁区散布有渔网等人为弃置物。

2024年4月至6月，自然资源部南海生态中心联合自然资源部南海发展研究院等单位，通过卫星遥感和现场调查对仁爱礁珊瑚礁生态系统状况进行了评估。调查包括使用2011年至2024年的高分辨率卫星遥感影像反演礁盘底质类型，计算20米以浅礁盘面积和不同底质类型覆盖面积，并沿礁盘周缘设置18个调查站点，开展珊瑚群落、礁栖生物、生境和人类活动等四大类共75项要素的调查。

报告强调，菲律宾军舰的长期“坐滩”对仁爱礁的生态系统造成了严重破坏，呼吁国际社会关注这一问题，并敦促相关方面采取措施，保护南沙群岛的珊瑚礁生态系统

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